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繁育时，为了追求更完美的外观，挑选特定条件的猫咪进行繁殖，以延续纯种猫的完美外观。这样虽然使猫咪的外观基因纯化，也会伴随出现的遗传性疾病。这些疾病有些会影响猫咪的生活，有些甚至会致命，而且往往治疗这些病会花费猫奴们很多钱。

1.肥大性心肌病

很多小动物心脏病学者都认为肥大性心肌病除了营养影响外，很大程度上与猫咪的基因有关。发病的猫咪可能出现突发性后驱瘫痪，喘息，粘膜苍白，发绀或突然死亡。且治疗费用不菲。

2.隐睾

如果超过6月龄的猫咪睾丸仍没有坠入阴囊，我们就说这只猫为隐睾。隐睾是具有遗传性的。睾丸长时间滞留在温度较高的腹膜腔内会诱发癌变。因此，患有音高的猫应尽早取出隐睾，以防癌变。

3.多囊肾

发病的猫咪大多会于四岁之前就出现慢性肾衰竭的症状，肾脏会持续出现增大的水囊肿，压迫肾脏实质导致肾脏发生机械性坏死或局部缺血性坏死。很多多囊肾都是双侧都发的，并且目前没有治疗方式可以消除或抑制水囊肿，因此患有此病的猫咪很多都会因为尿毒症而死亡。超声是发现早期多囊肾的好方法。而近期已经有人在研究决定多囊肾发病的基因，如果有朝一日可以准确的查出多囊肾基因，则此基因阳性者不能进行繁育，以减少悲剧发生。

4.苏格兰折耳猫自发性软骨瘤

苏格兰折耳猫本身就是基因突变的产物，因此，它的基因中有很多不确定性，在某些国家命令禁止两只折耳交配，因为有太多可能出现的先天缺陷或畸形发生。患有此病的猫咪在一岁时就可能出现严重的跛行。

5.髋关节发育不良

此病在很多大型犬中常见，但是在猫咪中也有可能发生。因为猫咪的体重较轻，所以即使得了这个病也不会出现太严重的症状，除非它变得特别胖，或者随着年龄增长，跛行会日益严重。

6.髌骨脱位

此病常见于很多小型玩具犬，虽然在猫咪中并不常见，但若发生了髌骨脱位，猫咪就会出现跛行的症状，长此以往，病情会恶化，因此，一旦发现脱位，则建议尽早进行手术，同时，这样的猫咪不能用作育种。

7.鼻泪管阻塞，咬合不正，上呼吸道感染，呼吸窘迫所发生的心血管疾病

这几个病放在一起说是因为这些病都是因为人类为了追求波斯猫的脸变得更瘪，鼻子变得更短，而使猫咪的器官相应的变得“畸形”，而引起的疾病。脸越扁，猫咪的鼻泪管就越扭曲（越容易堵塞，白波斯猫猫眼角脏脏的就是这个原因），牙齿也越容易不齐，鼻孔狭窄，会更容易感染细病菌引起上呼吸道感染。